Работна програма

WP6: Биоинформатика

Биоинформатиката е интердисциплинарен подход, който поддържа тесни връзки с природните науки за реализирането на пълния им потенциал и за правене на данните от тях по-разбираеми и полезни чрез прилагане на компютърни методи и подходи за събиране, съхранение, организиране и архивиране, анализиране и визуализиране на биологични, медицински и здравни данни. Тя е бързо развиваща се област, която стана особено важна по отношение на експерименталния дизайн, анализа и интерпретирането на експерименталните резултати от геномни, транскриптомни, протеомни и други експериментални проучвания. Развитието на биоинфармационно направление е задължително условие за създаването на център за върхови постижения, особено в обастта на транслиращата медицина. Независимо от съществуващите IT структури в бенефициентната институция ще са необходими допълнителни хардуеър, софтуеър, обучение и експертна подкрепа, за да се преодолеят дефицитите в тази област, което е основно ограничение за ефективността на дейностите и създаването на мрежа в условията на интегрирана и конкурентна среда. Сътрудничеството с Института по паралелна обработка, БАН [Партньор #10] допълнително ще подпомогне партниращите изследователи да разрешават проблеми с много по-голяма сложност, която превишава обикновените компетентности.

Цели

• да се създаде биоинформационно направление на базата на НСБАЛХЗ - София;
• да се разработи уеб-базиран “интранет” на проекта, който да позволи публикуването на
  • (a) проекта, ако бъде одобрен;
  • (б) докладите от срещите на партньорите;
  • (в) междинния и крайния отчет за напредъка на проекта;
  • (г) междинните и крайните резултати от текущите проучвания на изследователския екип;
  • (д) всичко останало, което се счита за важно за партньорите в мрежата;
• да се осигури достъп на участващите партньори до различни бази-данни;
• да се организират данните от биобанката по начин, който би ни позволил да поддържаме централизирани ресурси от всички проспективно събрани и съхранявани проби (включително демографски данни, клинични резултати, диагностични характеристики на пробите, резултати от образни изследвания, както и нови научни данни, получени от изследователите). Базата-данни ще бъде използвана за дизайна на проспективни проучвания, провеждани от участващите партньори, или при договаряне между всички страни за включване в национални и международни мрежи.
• да се обучат изследователи и студенти по биоинфроматика, за да се осигури ефективната употреба и интерпретация на данни.

Осъвременяване на оборудването

Съществуващата локална мрежа в СБАЛХЗ трябва да се осъвремени за целите на този проект. Ще се инсталират файлов сървър и 6 работни станции за надежден и бърз достъп до данните, генерирани в различните направления, които ще бъдат допълнени от мрежов високоскоростен и високопроизводителен цветен лазерен принтер. За всеки от партньорите #3-#8 ще бъде осигурен компютър, което ще позволи достъп до интранета и обмяна на получените данни.

Очаквани резултати

• локална компютърна мрежа
• интранет за проекта
• сигурна база-данни с добра оргонизация на информацията

Основни моменти

До месец 6. ще се извършат процедурите по закупване и инсталиране на оборудването. До този момент трябва да се разработи интранет и той да се поддържа по време на целия проект.

Етапен отчет (изтегли pdf файл)