Работна програма

WP1: Събиране и съхранение на клинични проби. Биобанка

Достъпът до добре характеризиран клиничен материал е основна предпоставка за изпълнението на последващите работни пакети. Затова от основно значение за успешното изпълнение на програма за транслиращи изследвания е поддържането на централизирана биобанка, която ще бъде в състояние да събира, обработва, съхранява и разпространява за изследвания биологични проби от хематологично болни, осигурени от участващите в проекта партньори според одобрени протоколи и процедури. Проектът предвижда събиране и съхранение на РНК, ДНК, кДНК, плазма, серуми, изолирани периферни левкоцити, клетъчни лизати от свежи и замразени туморни тъкани, замразени тъканни блокчета, парафинови блокчета от туморни тъкани, натривки и хистологични срези. Туморните тъкани включват солидни лимфомни маси, костно-мозъчни аспирирати, кръв и телесни течности от пациенти с хематологични неоплазии.

Думата „биобанка” се използва от около десетилетие и наскоро беше дефинирана от Организацията за икономическо сътрудничество и развитие (Asslaber and Zatloukal 2007) като „сбирка от биологични материали и свързаните с тях данни и информация, съхранявани в организирана система за определена група или за голяма подгрупа”. Милиони проби със свързани данни се поддържат в различни видове сбирки в ЕС. Понастоящем в европейските страни се полагат значителни усилия да се поддържат биобанки като се използват международни стандарти и се въвеждат политики за достъп (Yuille, et al 2008).

Понастоящем Лабораторията по цитопатология, хистопатология и имунология на НСБЛАХЗ съхранява значителен брой парафинови блокчета от тъкани и срези, представящи целия спектър от хематологични заболявания, включително редки хематологични неоплазии, от цялата страна, както и замразени серуми от пациенти с моноклонални гамапатии и клетъчни лизати от пациенти с остри левкемии и миелодисластични синдроми. Освен това в Лабораторията по цитогенетика и молекулярна биология се съхранява 10-годишна национална сбирка от РНК и от костен мозък/кръв от пациенти с остри и хронични левкемии. И двете лаборатории имат опит в съхранението, обработката и анализа на биологични проби. Затова основният проблем не са експертните познания, а по-скоро ограничените възможности и финансиране за поддържане на национална биобанка, която би подпомогнала текущите изследвания, следвайки стандартизирани процедури и одобрени политики за достъп за всички партньори. Биобанката ще олесни многоцентровите проучвания, което представлява единственият начин да се получат надеждни резултати в онкохематологията, както и ще съдейства за хармонизирането и изграждането на мрежи на национално и международно равнище.

Цели

• да се подготвят стандартни оперативни процедури (СОП) за събиране и съхранение на проби от пациенти и дефиниране на времевите моменти за вземане на проби;
• да се изработи политика за достъп за участващите партньори до биобанката;
• да се създадат централизирани адекватни условия за правилно изолиране и съхранение на клинични проби (РНК, ДНК, клетки от кръв и/или костен мозък, парафинови блокчета и срзи, замразени тъкани, серум, плазма) чрез осъвременяване на оборудването;
• да се съберат и съхраняват клинични проби от добре характеризирани пациенти с хематологични неоплазии и от здрави контроли;
• да се организират и поддържат досиета за набраните пациенти (демографски, клинични и лабораторни данни, анамнеза, данни за средата и поведенчески особености).

Осъвременяване на оборудването

За да се осигури надеждно и стабилно функциониране на широкомащабна биобанка бенефициентът се нуждае допълнително от: 2 стандартни хладилника (4°C/-20°C), 2 вертикални фризера за ниски температури (-86°C) с обем 300 l-500 l, 1 фризер за дълбоко замръзяване (-152°C), комплектован с подходящи алармени системи (250 l), баркод принтер и скенер, принтер за етикети за стъкла и флакони, клас II ламинарен бокс и достатъчен брой лавици за съхранение, платформа за изолиране на ДНК/РНК.

Очаквани резултати

• Изграждане на сигурна и ефективна система за биобанкиране на тъкани, клетки, определени подгрупи клетки, РНК, кДНК, ДНК, серум, плазма и тъканни течности.
• СОП за събиране, транспортиране и съхранение на проби от пациенти в дефинирани времеви моменти.
• СОП за екстракция и съхранение на РНК, ДНК, кДНК, клетъчни лизати.
• СОП за изолиране на определен вид клетки, които представляват интерес, и процедури за контрол на качеството по време на и след изготвяне на пробата.
• Документ за политиката за достъп за участващите страни до биобанката.
• Очаквани резултати са и самите събрани проби, заедно със съпровождащите ги необходими данни.

Основни моменти

СОП-овете и документа за политиката на достъп ще се разработят и разпространят между участващите партньор до месец 3. До месец 9. ще се извършат процедурите по закупуване и инсталиране на оборудването. До месец 12. се очаква цялото оборудване да функционира в пълен ход. Биологичният материал ще се съхранява и ще бъде достъпен за проспективни и ретроспективни проучвания, които ще се извършват от партньорите. То може да се използва за проучвания в областта на клетъчната биология, резистентността към цитостатици, цитогенетиката, молекулярната биология и т.н.

Етапен отчет (изтегли pdf файл)